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  • 動(dòng)物研究百邁客云解決方案-BMKCloud_數據庫收錄的牛屬數據所涉及研究方向

    解決方案概述

     

    針對動(dòng)物基因組學(xué)研究,百邁客云可通過(guò)BMKCloud_數據庫模塊向用戶(hù)提供海量的動(dòng)物高通量測序公共數據,借助公共數據,可大幅降低研究成本,提升研究層次。數據檢索、下載、保存均在圖形化界面下完成,避免了傳統模式中,須在命令行界面下進(jìn)行數據下載、格式轉換等一系列繁瑣操作的限制,完全適用于國內生信0基礎的用戶(hù)。

    對于公共數據的下游分析,百邁客云目前已實(shí)現公共數據模塊與分析模塊的無(wú)縫對接,用戶(hù)可直接將已保存至用戶(hù)目錄的數據直接導入BMKCloud_APP分析模塊進(jìn)行下游分析,該模塊同樣采用圖形化操作界面,無(wú)需用戶(hù)掌握任何編程基礎,高度集成化專(zhuān)業(yè)化的分析流程可保證用戶(hù)快速完成對數據的基礎分析以及必要的數據深度挖掘。

     

    整合mRNA公共測序數據,構建豬肉品質(zhì)相關(guān)miRNA-mRNA調控網(wǎng)絡(luò )

     

    方案實(shí)現過(guò)程

    1)進(jìn)入BMKCloud_數據庫模塊進(jìn)行數據檢索與保存。

    2)進(jìn)入BMKCloud_APP模塊,簡(jiǎn)單5步完成公共數據or自測數據導入及任務(wù)投遞。

    3)分析結果自動(dòng)生成,繼續使用個(gè)性化分析??焖偻瓿蓴祿疃韧诰?。

     

     

    BMKCloud_數據庫收錄的牛屬數據所涉及研究方向:

     

    疾病類(lèi)研究:膀胱癌 、牛副結核病、牛病毒性腹瀉、牛圓環(huán)病毒感染、牛支原體感染、牛皰疹病毒感染、裂谷熱病毒感染、大腸桿菌感染、結核分枝桿菌感染、多形腺瘤基因(PLAG)功能研究、繁殖力低下……

    生長(cháng)發(fā)育類(lèi)研究:繁殖力、發(fā)情周期、進(jìn)食效率、牛奶產(chǎn)量&品質(zhì)、牛背最長(cháng)肌品質(zhì)、牛肉品質(zhì)、脂肪生成、胚胎發(fā)育、胃腸道發(fā)育、試管胚胎、隱性致死基因鑒定……

    其他:基因組組裝、環(huán)境適應、遺傳進(jìn)化……

     

    文章思路

    ?Liu X et al. MicroRNA-mRNA regulatory networking fine-tunes the porcine muscle fiber type, muscular mitochondrial respiratory and metabolic enzyme activities. BMC Genomics. 2016

     

    百邁客云實(shí)現方案

     

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