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  • 這個(gè)課題組如何做到2年連發(fā)6篇文章?

    對于剛接觸高通量測序的小碩小博來(lái)說(shuō),海量的測序數據和難于上青天的分析結果讓每一個(gè)初次接觸它的老師們都望而生畏。同樣的測序數據在生信大神的手里妙筆生花,開(kāi)出一朵朵美麗而迷人的SCI論文。同為科研人的你,甚至自己想要的結果文件都不知道在哪里找。而這個(gè)研究小麥課題的老師,做到了什么才能在短短兩年之內發(fā)6篇測序相關(guān)的文章呢?

    作為一個(gè)科技服務(wù)工作者,自然能夠明白每一位老師的痛處和難點(diǎn),不過(guò)現在都2020年了,再也不是一個(gè)轉錄組1萬(wàn)元的天價(jià)了,那么現在從原始的測序數據到數據挖掘直至最后完美的SCI論文圖表,究竟是怎么出來(lái)呢?

    雖然君子遠庖廚,不過(guò)今天小編將為您帶進(jìn)后廚,為您娓娓道來(lái)。

     

    1、首先我們需要原始數據

    這部分數據一般來(lái)自于兩種渠道:一種是老師做的建庫測序后拿到的原始數據,這部分數據可以直接保存在百邁客云賬號下;另一種來(lái)自于已發(fā)表的轉錄組文章中的原始數據,關(guān)于這部分數據,老師可以在NCBI上根據文章的鏈接查找下載,然后直接將數據保存在自己的賬號下,然后進(jìn)行后續分析。

    2、一分鐘的分析任務(wù)投遞

    選擇合適的分析APP

     

    命名和選擇數據

     

     

    選擇參考基因組及設置差異分組

     

    任務(wù)提交后,根據樣本數據量,一般24-48h左右大家就可以看到一份完整的分析結題報告和分析數據了。


    講到這里可能有人會(huì )問(wèn):難道就這么簡(jiǎn)單?那人家好幾篇文章里面那些高大上的圖片都是大神用小工具做的嗎,小編可以負責任的告訴你們,不是的!我們還有很多隱藏功能

    第一:基因檢索。(小編選的蛋白是PPR蛋白,從4萬(wàn)多基因里面篩選出來(lái)60個(gè)PPR蛋白相關(guān)的基因,然后根據60個(gè)基因做GO分類(lèi)圖)。

     

    第二:WGCNA分析。這個(gè)分析主要是將基因模塊與表型數據或者表型樣本進(jìn)行關(guān)聯(lián),從而快速的鎖定一批候選基因。

     

     

    運行后打開(kāi)是下圖這樣的,對此圖有疑惑的可以點(diǎn)擊圖片左側的攝像頭。

     

     

    第三:最近很火的差異基因表達趨勢分析

     

     

    第四:108款分析繪圖工具(73款常用工具免費使用)。

     

    具體這些工具如何使用?百邁客云還有哪些隱藏功能呢?歡迎大家持續關(guān)注,小編會(huì )定期為大家進(jìn)行分享。

     

     

     

     



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