06月14 動(dòng)物研究百邁客云解決方案-BMKCloud_數據庫收錄的豬屬數據所涉及研究方向
解決方案概述
針對動(dòng)物基因組學(xué)研究，百邁客云可通過(guò)BMKCloud_數據庫模塊向用戶(hù)提供海量的動(dòng)物高通量測序公共數據，借助公共數據，可大幅降低研究成本，提升研究層次。數據檢索、下載、保存均在圖形化界面下完成，避免了傳統模式中，須在命令行界面下進(jìn)行數據下載、格式轉換等一系列繁瑣操作的限制，完全適用于國內生信0基礎的用戶(hù)。
對于公共數據的下游分析，百邁客云目前已實(shí)現公共數據模塊與分析模塊的無(wú)縫對接，用戶(hù)可直接將已保存至用戶(hù)目錄的數據直接導入BMKCloud_APP分析模塊進(jìn)行下游分析，該模塊同樣采用圖形化操作界面，無(wú)需用戶(hù)掌握任何編程基礎，高度集成化專(zhuān)業(yè)化的分析流程可保證用戶(hù)快速完成對數據的基礎分析以及必要的數據深度挖掘。
整合mRNA公共測序數據，構建豬肉品質(zhì)相關(guān)miRNA-mRNA調控網(wǎng)絡(luò )
方案實(shí)現過(guò)程
1）進(jìn)入BMKCloud_數據庫模塊進(jìn)行數據檢索與保存。
2）進(jìn)入BMKCloud_APP模塊，簡(jiǎn)單5步完成公共數據or自測數據導入及任務(wù)投遞。
3）分析結果自動(dòng)生成，繼續使用個(gè)性化分析?？焖偻瓿蓴祿疃韧诰?。
BMKCloud_數據庫收錄的豬屬數據所涉及研究方向：
疾病類(lèi)研究：豬多系統衰竭綜合征、豬生殖呼吸道綜合征、支氣管哮喘、豬偽狂犬病、豬弓形蟲(chóng)病、全反式維甲酸&抗病、豬圓環(huán)病毒感染、鼠傷寒沙門(mén)菌感染、口蹄疫病毒感染、豬巨細胞病毒感染、脊髓損傷……
生長(cháng)發(fā)育類(lèi)研究：繁殖力、同胎生仔數、胚胎發(fā)育、豬卵巢發(fā)育、生長(cháng)速度、豬肉品質(zhì)、食欲、脂肪組織發(fā)育、肌肉組織發(fā)育、豬背最長(cháng)肌分化……
其他：基因組組裝、環(huán)境適應、遺傳進(jìn)化……
文章思路
Khan FA et al. ? Analysis of Bos taurus and Sus scrofa X and Y chromosome transcriptome highlights reproductive driver genes. ? Oncotarget. 2017
百邁客云實(shí)現方案
