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  • 這一年,百邁客云平臺的華麗麗麗麗大變身 ——做科研,我們是認真的

    彈指一揮間,2017年轉眼就到了要跟大家告別的時(shí)刻,在上一期的年終大盤(pán)點(diǎn)中跟大家分享了百邁客云平臺用戶(hù)的傲人成績(jì),在累累碩果的背后,一直有著(zhù)一群兢兢業(yè)業(yè)的生信人,這一年里,他們是根據廣大用戶(hù)的體驗反饋,不斷改進(jìn),不斷更新,使咱們的云平臺來(lái)了一場(chǎng)華麗麗的大變身。細數這一年,云平臺總共更新53次,更新項目達200多個(gè),包括新主流程的上線(xiàn),頁(yè)面版塊的調整,分析功能的完善,數據庫的改進(jìn),平臺速度的提升等。每一次改進(jìn)都是為了使云平臺的用戶(hù)有一個(gè)更好的分析體驗,每一次更新都希望用戶(hù)可以有更高效的科研產(chǎn)出。今天,咱們一起來(lái)瞅瞅百邁客云平臺17年到底有哪些大變樣。

     

    2017全新上線(xiàn)篇

    “讓基因分析更簡(jiǎn)單”是百邁客云平臺前進(jìn)的不竭動(dòng)力,相信大家最關(guān)心的應該是云平臺這一年有哪些新的分析流程上線(xiàn)。

    2017

    4/14??云平臺上線(xiàn)lncRNA v3.0主流程;

    4/21??全基因組關(guān)聯(lián)(GWAS)分析平臺(Beta版,云服務(wù)個(gè)性化)正式上線(xiàn);

    6/9???BSA 分析平臺 v1.0(Beta版,云服務(wù)個(gè)性化)正式上線(xiàn);

    9/22??全基因組重測序分析平臺3.0正式上線(xiàn)。做lncRNA,GWAS,BSA,全基因組重測序分析的用戶(hù)有福啦!

    另外,早在2017年3月3日,咱們云平臺的云組第一期已正式上線(xiàn),實(shí)現了組內成員計算、存儲、工具的資源共享等功能,一個(gè)課題組的成員們可以同時(shí)享用同一個(gè)分析平臺,再也不用為互傳數據和結果而煩憂(yōu);

    2017年6月30日 ,移動(dòng)端微信公眾號全新改版,在百邁客云微信公眾號中添加文獻檢索、文獻解讀、文獻收藏、云賬號綁定、項目進(jìn)展查看和評價(jià)等功能,同期,在線(xiàn)支付功能上線(xiàn),套餐用戶(hù)支持使用支付寶、微信在線(xiàn)購買(mǎi)分析平臺、小工具,收貨地址與個(gè)人信息關(guān)聯(lián),用戶(hù)可以在線(xiàn)填寫(xiě)發(fā)票信息。

     

    APP主流程更新篇

    這么多新的APP成功上線(xiàn)了,顯然是一件值得慶賀的事情,無(wú)獨有偶,咱們已經(jīng)在線(xiàn)上的APP也從來(lái)沒(méi)有停止前進(jìn)的步伐。

    2017

    1/20??無(wú)參轉錄組分析APP進(jìn)行了全面更新還實(shí)現了圖片和基因之間的交互,新增“WGCNA”個(gè)性化工具,新增基因結構挖掘功能等功能;

    3/3??微生物多樣性分析APP更新至2.0版,新增6項分析內容;并且美化了流程中各步驟生成的圖片,確保所有圖形結果有png圖和矢量圖等功能;

    3/17??微生物多樣性分析APP再次更新:增加5個(gè)個(gè)性化分析內容;同期,小RNA測序分析APP也進(jìn)行了20多項更新:增加小RNA所對應的染色體、起始點(diǎn)、終止點(diǎn)信息和miRNA對應的前體位置信息,支持更加精細化的檢索,添加一鍵繪圖等功能;

    3/26??微生物多樣性分析APP更新了引導教程圖片;

    6/16??微生物多樣性分析APP進(jìn)行了功能更新:基本分析和個(gè)性化中RDA/CCA環(huán)境因子支持文件上傳,增加保存歷史參數功能等;

    7/7??ChIP-Seq 分析APP的基本分析,增加了Input/IP設置,且支持有生物學(xué)重復的差異分析等功能;

    7/21??真核生物有參/無(wú)參分析APP個(gè)性化分析進(jìn)行了更新:基因挖掘中相應添加eggNOG分類(lèi)圖、KEGG分類(lèi)圖、KEGG富集圖、GO富集圖、MA圖和火山圖等;

    7/28??真核生物有參/無(wú)參分析APP個(gè)性化添加差異分組時(shí)增加Pvalue選項;

    8/25??lncRNA分析APP進(jìn)行了20多項的更新:新增圖片交互功能,增加火山圖、MA圖,增加矢量圖, Readme.pdf文件,WGCNA分析等;

    9/1??微生物多樣性分析APP個(gè)性化更新,增加21個(gè)個(gè)性化且每個(gè)個(gè)性化都有多個(gè)參數可以調整分析;

    12/1??微生物多樣性APP第四期更新:對OTU個(gè)數分布圖、物種分布柱狀圖、PCA分析等15項進(jìn)行了優(yōu)化。

     

    極速體驗更新篇

    為了方便用戶(hù)能夠在短時(shí)間內體驗到云平臺的標準分析和個(gè)性化分析內容,研發(fā)人員特意準備了極速體驗項目,標準分析在兩分鐘內得到結題報告,隨后即可進(jìn)入個(gè)性化分析流程。

    2017

    3/31??有參、無(wú)參、表達譜,小RNA,四個(gè)分析平臺更新了極速體驗項目,增加示例數據;

    6/30??群體三個(gè)分析平臺(BSA、全基因組關(guān)聯(lián)、基于第二代測序標記的遺傳圖譜)增加極速體驗功能。目前已有極速體驗的分析平臺包括:真核生物有參轉錄組分析平臺、真核生物無(wú)參轉錄組分析平臺、小RNA測序分析平臺、LncRNA測序分析平臺、微生物多樣性分析平臺、數字基因表達譜分析平臺、醫學(xué)有參轉錄組分析平臺、外顯子組測序分析平臺。

    是不是要為咱們的研發(fā)人員打個(gè)call?

    云課堂更新篇

    百邁客云課堂,絕對是您科研路上的好幫手。2017年百邁客云課堂先后共進(jìn)行了5次更新,現在的云課堂集185+線(xiàn)上培訓課程于一體,囊括RNA系列、DNA系列、生物信息軟件使用和大家講壇等課程,針對分析平臺每款APP都有詳細說(shuō)明及步驟提示,無(wú)論有沒(méi)有生物信息學(xué)基礎,都能幫助用戶(hù)在短期內玩轉各類(lèi)分析。

     

    數據庫更新篇

    整合利用公共數據發(fā)表論文是近年來(lái)的研究熱點(diǎn),2017年百邁客云平臺數據庫先后更新9次,包含8大數據庫、12PB公共數據、373萬(wàn)樣本,共收錄826個(gè)參考基因組、2000+種醫學(xué)數據、306萬(wàn)互作網(wǎng)絡(luò )關(guān)系、1700萬(wàn)基因、8億變異數據。

     

    小工具更新篇

    2017年云平臺小工具先后更新了4次,包含PCA分析、WGCNA分析、轉錄因子預測、遺傳共線(xiàn)性分析、GO富集分析、聚類(lèi)熱圖、柱狀圖、點(diǎn)線(xiàn)圖、miRNA基因家族分類(lèi)等104款小工具和3大工具集,覆蓋12大功能類(lèi)別:基因分析、遺傳進(jìn)化、ncRNA、質(zhì)控、組裝、比對、數據提取、突變、統計、表格處理、繪圖、序列分析等。

     

    文獻功能更新篇

    2017年云平臺對文獻模塊先后進(jìn)行了3次更新,如今查找文獻和數據導入都非常方便,共整合了2700+萬(wàn)篇文獻,同步NCBI數據,設置多項過(guò)濾欄,方便快速查找,還可輕松獲得全文解讀,文章數據可一鍵導入分析。

     

    云平臺其他功能更新篇

    2017

    3/10?云平臺建立項目進(jìn)展查詢(xún)機制,用戶(hù)通過(guò)云平臺可以及時(shí)了解項目進(jìn)度,增加項目線(xiàn)上評價(jià)功能,用戶(hù)可以在線(xiàn)對項目各個(gè)維度的服務(wù)進(jìn)行評價(jià),我們可以通過(guò)評價(jià)提升項目服務(wù)質(zhì)量,以及對頁(yè)面內容進(jìn)行整理更新,使項目的管理更清晰;

    4/10??云平臺結題報告進(jìn)行全面優(yōu)化,包括加載速度和流暢度,右側導航可以智能展開(kāi)和收起,圖片可調大,添加專(zhuān)有名詞解釋?zhuān)?/p>

    5/19??Venn圖支持多個(gè)區域選擇,WGCNA添加分類(lèi)模塊功能富集結果圖的展示,轉錄因子支持動(dòng)物物種的預測,有參支持按照指定基因名稱(chēng)替換;

    5/26??云科技官網(wǎng)上線(xiàn)文獻檢索、功能基因數據庫和學(xué)術(shù)課堂功能,不用登陸即可體驗超強功能;

    7/14??真核有參、小RNA測序、微生物多樣性、ChIP-Seq分析平臺增加pdf格式結題報告下載功能;

    7/21??云平臺登錄支持第三方微信便捷登錄;

    9/22??為了用戶(hù)在體驗過(guò)程中的流暢度,在平臺登錄頁(yè)面添加了瀏覽器使用建議。貼心無(wú)處不在~

     

    告別成績(jì)斐然的2017,迎來(lái)了充滿(mǎn)希望的2018,我們堅信新的一年百邁客云平臺(BMKCloud)一定會(huì )再創(chuàng )輝煌,為廣大用戶(hù)提供一個(gè)更加完美的數據分析平臺。作為一個(gè)生物大數據分析的開(kāi)放云平臺,擁有龐大的專(zhuān)業(yè)用戶(hù)群和開(kāi)發(fā)者用戶(hù)群(15000+),為用戶(hù)提供完整的生物信息分析以及整合利用公共數據的解決方案,我們一直在努力!



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