
01月08 這是一個(gè)神奇的網(wǎng)站……(下)
隨著(zhù)測序成本越來(lái)越低,一些重要物種數據呈指數級積累,其中蘊含著(zhù)巨大價(jià)值。物種數據研究能為解答基因組進(jìn)化學(xué)、系統發(fā)育學(xué)問(wèn)題提供參考,有利于指導育種工作及保護物種多樣性。因此構建物種數據庫具有重要意義:
01物種數據庫可作為系統性的展示、查詢(xún)、分析的平臺:實(shí)現物種多組學(xué)數據的高效檢索、保存、調用、分析及深度挖掘。
02一些具備創(chuàng )新特性的數據庫也可單獨作為一項研究成果在SCI論文中進(jìn)行展示。
03通過(guò)共享云用戶(hù)的訪(fǎng)問(wèn),可提升第三方數據庫的知名度,部分重要物種信息、重要分析結果可以收費下載,為進(jìn)一步維護數據庫和科研工作提供資金。
1.百邁客云物種數據庫概述
百邁客作為一家擁有深厚基因組學(xué)數據分析行業(yè)背景的大數據挖掘分析公司,致力于為用戶(hù)設計更貼合使用習慣的基因組學(xué)數據庫系統,在2017年正式推出搭建百邁客云物種數據庫的服務(wù)。
簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),百邁客云物種數據庫是針對物種基因組學(xué)數據的存儲、管理、查詢(xún)、分析的數據庫系統。用戶(hù)基于Web操作界面即可實(shí)現數據的增刪改查等操作,還可以利用數據庫部署的簡(jiǎn)單分析工具或結合百邁客云賬號進(jìn)行數據挖掘分析。
說(shuō)了那么多是不是有些心動(dòng)了呢?
跟隨小編一起看下百邁客云物種數據庫核心優(yōu)勢有哪些。
2.百邁客云物種數據庫優(yōu)勢
操作更簡(jiǎn)單:后臺管理權限,甲方無(wú)需配備專(zhuān)業(yè)IT運維和美工,在乙方培訓后,即可完成后期的數據增加、刪除等更新操作
查詢(xún)調用更高效:代替原始的硬盤(pán)存儲+手動(dòng)查找的傳統數據管理模式,引入互聯(lián)網(wǎng)領(lǐng)域的數據庫技術(shù),可將各時(shí)間點(diǎn)、各空間點(diǎn)、各類(lèi)型數據結構化地存儲于統一的數據庫框架中,借助數據庫自動(dòng)查詢(xún)語(yǔ)言與web2.0網(wǎng)頁(yè)界面即可實(shí)現基因組學(xué)數據的高效查詢(xún)和調用。避免了傳統數據管理模式下數據丟失率高及檢索困難等問(wèn)題
數據挖掘更輕松:強大的云平臺支持,可連接百邁客云其他數據庫(八大數據庫,如功能基因庫、參考文獻數據庫等),并可使用百邁客云分析工具(如幾十款分析APP、一百多款小工具),基于A(yíng)PP和小工具完成數據的深度挖掘
3.百邁客共建數據庫的成功案例
那么我們看下百邁客有哪些成功案例吧!
中國農科院大豆數據庫(www.soybean-resources.cn)
包含了約1500種大豆種質(zhì)資源,382個(gè)品種的重測序,7套泛基因數據。
中科院植物所構樹(shù)數據庫(papyrifera.biocloud.net)
包含了構樹(shù)基因組序列及注釋信息,可進(jìn)行數據的瀏覽、使用、下載。
4.數據庫搭建流程
01需求論證(2~4周)
用戶(hù)設定模塊組合及各模塊對外權限,可選擇部署到本地服務(wù)器或托管于百邁客云數據庫專(zhuān)用集群;
乙方完成原型設計,并與甲方確認后核算搭建成本并報價(jià),乙方核算報價(jià),甲方支付20%的預付款。
02開(kāi)發(fā)(3個(gè)月)
基于數據庫原型,制定出數據標準化格式、文本需求信息,協(xié)助用戶(hù)數據準備工作;
依次完成UI設計、前端架構、后端完成底層數據的存儲與頁(yè)面相關(guān)交付;進(jìn)行測試驗收。
03交付
雙方共同完成測試后,甲方需在驗收合格10個(gè)工作日內支付80%尾款,乙方交付數據庫并協(xié)助甲方進(jìn)行日常維護更新。
04日常維護與更新
每日巡檢,檢查機房用電、溫濕度,服務(wù)器硬件報警及維修;
服務(wù)器操作系統狀態(tài)監控與報警、日常維護、操作系統及軟件版本更新;
服務(wù)器生產(chǎn)服務(wù)與軟件的狀態(tài)監控與報警、版本更新;
數據庫服務(wù)狀態(tài)監控與報警,數據定期檢查與備份;
甲方在乙方協(xié)助下自主完成增刪改等操作。