12月21 篇篇捷報至，累累碩果繁——百邁客云平臺，您的生信分析智囊團

百邁客云作為針對生命科學(xué)家的“Turn-key?BioCloud”，2015年初出茅廬，2016年開(kāi)始全國推廣，一路走來(lái)得到了像中科院陳潤生院士等生信領(lǐng)域權威專(zhuān)家的大力支持和幫助。百邁客云日臻完善，集成式的計算資源和工具、交互性的操作界面、開(kāi)放性的公共數據庫、實(shí)用的培訓講堂、專(zhuān)業(yè)的開(kāi)發(fā)支持團隊、一站式體驗模式，成為廣大科研工作者生信分析智囊團，極大地加速了科研創(chuàng )新孵化進(jìn)程，僅2017年一年內基于BMKCloud分析發(fā)表的SCI可謂是層出不窮,捷報頻傳。

研究熱點(diǎn)揭秘

截止到11月3日，已發(fā)SCI數達到19篇，研究對象涵蓋了糧食作物、經(jīng)濟作物、人、家禽家畜、水產(chǎn)、林木、花卉、瓜果等類(lèi)型。植物類(lèi)占比52.63％，動(dòng)物類(lèi)占比42.11％，醫學(xué)類(lèi)占比5.26％。發(fā)表的雜志有Archives of Toxicology（IF=5.905）、Frontiers in Plant Science（IF=4.298）、Scientific Reports?（IF=4.259）等。累計影響因子為65.3。

云平臺對這些文章都做了詳盡梳理解析，點(diǎn)擊即可查看：

OsbZIP46、SAPK6基因共同過(guò)表達提升水稻抗旱能力Frontiers in Plant Science IF:4.298

通過(guò)轉錄組分析揭示馬杜霉素在原代雞心肌細胞中的毒性Archives of Toxicology ?IF:5.905?

小麥與禾谷胞囊線(xiàn)蟲(chóng)在侵染初始階段的轉錄組響應 Scientific Reports IF:4.259

蕪菁花芽轉錄組比較分析解析多倍體異常減數分裂過(guò)程Frontiers in Plant Science IF:4.298

單側眼組織缺損和視網(wǎng)膜裂癥的家族遺傳原因Sci Rep .IF:4.259

圖1 2017年基于BMKCloud分析發(fā)表的部分SCI文章

產(chǎn)出單位分布

從通訊作者所屬地域來(lái)看的話(huà)，這些云平臺的用戶(hù)主要分布在全國12個(gè)省、直轄市，其中產(chǎn)出最多的單位是南京農業(yè)大學(xué)，17年基于BMKCloud發(fā)表了3篇SCI（累計IF 13.23），短期連發(fā)多篇文章的老師也不少，南海水產(chǎn)所喻達輝老師4個(gè)月內連發(fā)兩篇（累計IF 6.298），南京農業(yè)大學(xué)的張艷麗老師更是在短短2個(gè)月內連發(fā)兩篇（累計IF 7.329）

圖2 部分科研單位的地理分布

分析平臺熱度排行

百邁客BMKCloud已推出25款分析平臺，包括真核生物有參轉錄組、真核生物無(wú)參轉錄組、小RNA、長(cháng)鏈非編碼RNA、微生物多樣性、重測序、ChIP-Seq、CircRNA、全轉錄組聯(lián)合分析等多個(gè)平臺，覆蓋轉錄調控、微生物多樣性、個(gè)體重測序、群體個(gè)性化分析等多種組學(xué)分析項目，可滿(mǎn)足所有分析高通量測序數據整合分析及深度挖掘的需求。

從2017年已發(fā)表的SCI文章來(lái)看，使用頻率最高的是有參轉錄組分析平臺,占比63％，lncRNA分析平臺和小RNA分析平臺占比11％，另外醫學(xué)外顯子分析平臺、微生物多樣性分析平臺、甲基化分析平臺各占比5％。

圖3 百邁客分析平臺使用熱度一覽

云課程 讓生物信息更簡(jiǎn)單

BMKCloud部署了185+課時(shí)的線(xiàn)上培訓，囊括RNA系列、DNA系列、生物信息軟件使用和大家講壇等課程，每款APP（分析平臺）都有詳細說(shuō)明及步驟提示，無(wú)論有沒(méi)有生物信息學(xué)基礎，用戶(hù)都能夠在短期內玩轉各類(lèi)分析。這些作者中有42.86％的老師是完全不懂生信的，約有50％的老師略知一二，僅7.14％對生信分析較了解。

BMKCloud熱門(mén)個(gè)性化分析

除了主流程APP之外呢，BMKCloud上也部署了104個(gè)分析工具、3款工具集。涵蓋12大功能類(lèi)別（基因分析、遺傳進(jìn)化、ncRNA、質(zhì)控、組裝、比對、數據提取、突變、統計、表格處理、繪圖、序列分析等）?；旧峡蓾M(mǎn)足所有轉錄組學(xué)分析的需求。圖4展示了19篇文章中熱門(mén)的個(gè)性化分析

圖4 BMKCloud個(gè)性化分析示例

僅從這19篇SCI內相關(guān)分析內容來(lái)看的話(huà)，使用次數最高的分析依次是GO分析、熱圖、KEGG分析、韋恩圖和COG分析。其中熱圖和GO分析使用率最高，均達到52.63%（圖5）；此外共表達趨勢分析，蛋白互作分析等分析也應用較多。

圖5 BMKCloud個(gè)性化分析熱度一覽

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BMKCloud的便捷度

BMKCloud使用便捷，助您多角度進(jìn)行分析挖掘，隨時(shí)隨地抓住分析靈感。

這些研究者中有35.71％的老師選擇在8：00-19:00進(jìn)行分析，選擇晚上進(jìn)行分析的老師占比21.43％，凌晨進(jìn)行分析的占比7.14％。

這些研究者中所有擁有BMKCloud年賬號的用戶(hù)會(huì )對同一批樣本進(jìn)行2-4次分析和挖掘，而實(shí)現這些僅需要修改參數、閾值或更換參考基因組等后重新投遞任務(wù)即可。避免了傳統科技服務(wù)模式中多環(huán)節溝通，多次收費，出錯率高的問(wèn)題。

BMKCloud的速度

幾乎所有的研究者從拿到數據到分析完成所需周期都在3個(gè)月內。35.7%的研究者1個(gè)月內就完成了文章內的全部分析內容，其他的研究者拿到數據到發(fā)表文章的周期都控制在6個(gè)月內。其中，中國農科院油料研究所胡瓊老師項目組使用有參轉錄組分析平臺投遞了200G數據，7天就完成了整個(gè)主流程及個(gè)性化分析。

BMKCloud的口碑

云平臺分析和文章轉化的高效贏(yíng)得了15000+用戶(hù)以及廣泛的認可度，所有研究者都對我們的演示、售后及便捷度做出了很高的評價(jià)，并表示愿意推薦給身邊的科研同事及圈內朋友。2017年借助BMKCloud取得累累碩果的研究者們對云平臺評價(jià)如下：

（1）簡(jiǎn)單方便（流程標準化，圖形化，操作簡(jiǎn)單，使用快捷，節省時(shí)間）；

（2）靈活自由（參數設置可隨意更改，可隨時(shí)隨地分析以及查看進(jìn)度）；

（3）可重復（可多次分析，分析工具種類(lèi)多樣，可以幫助挖掘出新的分析點(diǎn)）；

（4）云課堂以及文獻資源很實(shí)用；

（5）數據儲存空間大；

（6）公共數據庫是大亮點(diǎn)。

廣大科研用戶(hù)的肯定，科研探索的累累碩果是對我們最好的肯定與鼓勵。百邁客將一如既往地秉承“成就客戶(hù)”的服務(wù)理念，持續迭代開(kāi)發(fā)“云模式”，繼續引領(lǐng)科技服務(wù)2.0時(shí)代，更好地服務(wù)于廣大科研工作者。也希望越來(lái)越多的課題組能夠享受到云平臺的便捷與高效，發(fā)表更多更優(yōu)質(zhì)的文章！

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年末福利

年底我們對老客戶(hù)發(fā)文有感恩活動(dòng)，如果您基于平臺分析發(fā)表了SCI文章并引用了BMKCloud或www.holisticcircumcision.com，即可獲贈1個(gè)月現有賬號使用權限！

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BMKCloud有別于傳統的“服務(wù)器+命令行”的生信分析模式，是一種人人都可以分析的新型分析模式。百邁客云平臺代表了科技服務(wù)的新趨勢，我們已步入云端可視化自主分析的基因科技服務(wù)2.0時(shí)代了！

為感恩回饋各位新老用戶(hù)對百邁客云的支持與關(guān)注，百邁客云現推出72款生物信息分析小工具供免費使用，希望在科研路上助您一臂之力！注冊百邁客云平臺即可免費使用。